在赢得第七枚徽章后，小智一行向着最终的道馆城市进发。然而旅途中，一只神秘精灵“噗尼”突然出现，它散发的不详气息竟让皮卡丘的电气失控！更令人不安的是，整座白雪市被诡异的电磁场笼罩，道馆训练家早已不知所踪。当传说宝可梦的轮廓在暴风雪中若隐若现，小智发现——这最后一战，将揭开精灵世界与人类文明之间从未示人的黑暗连结。