当士官候补生千早群像与同伴们意外登上一艘沉睡的旧帝国海军潜艇“伊401”，命运的齿轮开始转动。他被迫成为这艘神秘战舰的临时舰长，而战舰的意志——少女伊欧娜，正凝视着他。一场关乎人类存亡、跨越迷雾海域的终极对决即将展开，他们面对的不仅是汹涌的波涛，更是深海中觉醒的钢铁巨兽与未解的古老谜团。