当K隆星最精锐的暗杀部队“暗黑K隆星人”降临，地球与KERORO小队的日常被彻底颠覆。军曹被迫直面自己的黑暗镜像，一场决定星球命运的空中决战在云层之上爆发。昔日搞笑的侵略者，如今必须为守护这个意外称之为“家”的蓝色星球而战。