2009年，天才女警当麻从FBI学成归来，被调入专门处理超常事件的公安第五课。一系列离奇命案正在发生——多名石油企业高管的心脏上，竟残留着被人徒手捏握的诡异痕迹。这背后，是被称为“SPEC持有者”的超能力者在暗中行动。与此同时，神秘少年一十一受雇保护企业高层，却将当麻视为杀害父母的仇人“爆弹女”。当好友在美国惨遭杀害，当麻意识到自己已卷入一场超越常识的战争。SPEC能力者之间的对决悄然展开，而世界的命运，正在进入倒计时……