1999年,馆山市的噩梦被一辆卡车悄然运走。几天后,哥斯拉登陆,自卫队苦战,队员家城茜在战斗中背负着战友死亡的阴影活了下来。四年后,人类以初代哥斯拉骸骨为蓝本,打造出终极兵器——机械哥斯拉3式机龙。茜成为它的操作员。然而首次实战,机龙竟被哥斯拉的吼声唤醒原始兽性,在城市中暴走。科学家改良了机龙,但恐惧让高层不敢再动用。直到哥斯拉再度降临,将东京品川化为火海。最终决战一触即发。茜驾驶着这台曾失控的钢铁巨兽,直面夺走她一切的那个怪物。这一次,是机龙吞噬哥斯拉,还是兽性再次吞噬人类?火海之中,茜与机龙的命运,将决定城市的存亡。
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