近未来日本，警方在神秘机械暴徒前溃不成军。女警秋夏子命悬一线之际，被魔法战士Cutie Honey所救。此后，每当罪恶蔓延，这道粉色身影便如利刃划破黑暗。她对抗的是操纵超能力的犯罪帝国“番撒圣衣”，其四天王与首领希斯塔吉尔正将日本拖入深渊。Cutie Honey与记者早见青儿、女警秋夏子结成三角同盟，在钢铁与魔法的碰撞中，她隐藏的身世之谜正随着战斗层层剥开——而每道伤疤背后，都藏着改变战局的关键记忆。